聚合采样检测病原体和抗菌素耐药性基因与美国料场的牛呼吸系统疾病相关:试点研究
Erin Jobman1,2, Brian Vander Ley3, John Dustin Loy3
1Production Animal Consultation, 307 S. Main, Scott City, KS 67871, USA.
Veterinary sciences
|April 23, 2025
概括
这项研究探讨了使用水槽进行总样采集,以检测牛呼吸系统疾病 (BRD) 病原体. 水槽采样显示了在养区有效的BRD监测的前景.
科学领域:
- 兽医医学 兽医医学 兽医医学
- 动物卫生 动物健康
- 病原体检测检测 病原体检测
背景情况:
- 牛呼吸系统疾病 (BRD) 是料场牛经济损失的主要原因.
- 目前对BRD的诊断方法是劳动密集型,耗时,并限制动物.
- 综合采样方法在牛肉行业的疾病监测中未得到充分利用.
研究的目的:
- 调查使用水槽作为BRD检测总样取样基材的可行性.
- 评估水槽样本对识别与BRD相关的病毒,细菌和抗菌素耐药性 (AMR) 基因的有用性.
- 为了比较水槽采样与传统的扫描方法.
主要方法:
- 试点研究涉及10个水箱,采样10次.
- 多重PCR用于检测水和拭子样本中的病毒,细菌和AMR基因.
- 用贝叶斯隐藏类分析来估计检测概率.
主要成果:
- 在水和拭子样本的发病率类别之间观察到病毒和细菌PCR检测的显著差异.
- 水和片基板之间的总体一致性很高 (kappa=0.72,84.01% 积极一致性).
- 确定了最佳检测窗口:在4-21天对病毒/细菌的峰值灵敏度,在42-56天的峰值特异性;AMR基因显示一致的检测.
结论:
- 水槽可以作为一个可行的集成采样基质,用于检测受限牛中的BRD病原体和AMR基因.
- 与个人动物诊断相比,这种方法为BRD监测提供了一种潜在的劳动密集度较低的方法.
- 需要进行进一步的研究,以优化肉牛健康管理的总样本采集策略.
