生物活性植物化合物的分子活性抑制宿主细胞附着和膜融合,与西尼罗河病毒包膜糖蛋白相互作用
Noimul Hasan Siddiquee1,2, Shanjida Akter Joyoti2,3, Bushra Binte Zaker2,4
1Department of Microbiology, Noakhali Science and Technology University, Noakhali, Bangladesh.
PloS one
|April 24, 2025
概括
这项研究确定了潜在的植物化学药物候选者Cianidanol和L-Rhamnose,用于西尼罗河病毒 (WNV) 治疗,通过计算准其信封糖蛋白. 这些化合物显示出有前途的稳定性和结合亲和力,这表明未来的临床前开发.
科学领域:
- 计算机化药物发现.
- 病毒学 病毒学
- 药品化学 药品化学 是一个
背景情况:
- 西尼罗河病毒 (WNV) 是一种蚊子传播的树状病毒,没有特定的治疗方法,构成严重的公共卫生威胁.
- 新型抗病毒疗法的迫切需要是由WNV爆发的全球发病率,潜在致命性和经济影响的增加所驱动的.
- 药物耐药性是广泛的抗病毒药物的关注点,需要针对WNV的向药物设计方法.
研究的目的:
- 识别具有对西尼罗河病毒潜在治疗活性的新型植物化学化合物.
- 用计算方法评估选择的植物化学品与WNV包膜糖蛋白的结合亲和力和稳定性.
- 评估这些化合物的潜力作为临床前药物开发的领先候选人,以对抗WNV.
主要方法:
- 分子对接被用来选来自IMPPAT数据库的5375种植物化学物质与WNV信封糖蛋白对比.
- 使用分子对接和MM-GBSA计算结合能,随后进行分子动力学模拟以评估复杂稳定性.
- 主要组件分析 (PCA) 和动态交叉相关矩阵 (DCCM) 用于分析模拟轨迹.
主要成果:
- 醇 (CID: 359),醇 (CID: 9064) 和L-Rhamnose (CID: 25310) 与WNV包膜糖蛋白具有强烈的结合亲和关系.
- 分子动力学模拟表明,由Cianidanol和L-Rhamnose与目标蛋白形成的复合物具有很高的稳定性.
- PCA和DCCM分析证实了Cianidanol和L-Rhamnose复合物的优越稳定性,表明了强大的相互作用.
结论:
- 香醇 (来自Tamarindus indica) 和L-Rhamnose (来自Plantago ovate) 显示出作为抗西尼罗河病毒的植物化学治疗候选物的显著潜力.
- 这些化合物有效地向WNV包膜糖蛋白,为进一步药物开发表现出有希望的临床前特征.
- 该研究为体内和动物试验提供了基础,以验证这些已识别的植物化学物质作为新型WNV疗法.
