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Updated: May 10, 2025
07:50
Genome-Wide Analysis of DNA Methylation in Gastrointestinal Cancer
Published on: September 18, 2020
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基于无细胞DNA甲基化的肝细胞癌的非侵入性预后
Ran Hu1,2,3, Benjamin Tran4, Shuo Li1
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, David Geffen School of Medicine, University of California at Los Angeles, Los Angeles, California, United States of America.
PloS one
|April 25, 2025
概括
无细胞DNA (cfDNA) 甲基化显示出作为肝细胞癌 (HCC) 的非侵入性预后生物标志物具有前景. 这种新的方法可以将患者分为风险组,提高预后准确度,超出目前的方法.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 目前使用成像和α-fetoprotein (AFP) 的肝细胞癌 (HCC) 的非侵入性预后方法的有效性有限.
- 新的预后生物标志物对于改善HCC治疗决策至关重要.
- 无细胞DNA (cfDNA) 甲基化变化正在成为癌症诊断和预后的潜在生物标志物.
研究的目的:
- 评估cfDNA甲基化的潜力,作为一种非侵入性预测剂,用于在患有活跃,放射可行的HCC.患者的预后.
- 评估基于cfDNA甲基化风险评分对HCC患者整体存活 (OS) 的歧视力.
- 确定cfDNA甲基化是否可以在与现有风险指数集成时改善预后评估.
主要方法:
- 分析了来自377个HCC瘤和50个正常组织的Illumina HumanMethylation450阵列数据,以确定与OS相关的158个与HCC相关的DNA甲基化标记.
- 在29个HCC瘤组织中验证了已识别的签名.
- 将签名应用于52名独立HCC患者的血cfDNA,使用随机生存森林模型计算基于cfDNA甲基化风险评分 (methRisk).
主要成果:
- 基于cfDNA的methRisk显示出强大的歧视力,作为OS的单一预测因子 (3年AUC=0.81).
- 将methRisk与巴塞罗那诊所肝癌 (BCLC) 阶段测定相结合,显著改善了预后评估 (3年AUC = 0.91).
- 在多变量考克斯模型 (P = 0.007) 中,methRisk被确定为生存的独立预测因子.
结论:
- 来自外围血液的cfDNA甲基化生物标志物可以有效地将HCC患者分为临床上有意义的风险组.
- cfDNA甲基化代表了HCC的一个有希望的非侵入性预后生物标志物.
- 这项研究为cfDNA甲基化在HCC预后中的临床实用性提供了概念证明.
