开发和评估电子健康记录衍生可计算的表型,以识别接受前列腺癌查的患者
Patrick Lewicki1, Yasmin Benhalim1, Joshua Bradin1
1Department of Urology, University of Michigan, Ann Arbor, MI.
JCO clinical cancer informatics
|April 25, 2025
概括
电子健康记录数据可以研究前列腺特异性抗原 (PSA) 查. 有效的可计算的表型对于使用PSA测试数据进行精确的前列腺癌查研究至关重要.
科学领域:
- 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科
- 医疗信息学 医疗信息学
- 癌症查研究 癌症查研究
背景情况:
- 电子健康记录 (EHR) 为研究前列腺特异性抗原 (PSA) 查前列腺癌提供了宝贵的资源.
- 传统数据源存在挑战,例如随机试验和保险索赔.
- 经过良好的评估,可计算的表型对于可复制的基于EHR的研究至关重要.
研究的目的:
- 在电子健康记录数据中开发和评估可计算的表型,用于识别前列腺特异性抗原 (PSA) 查.
- 确保对查的严格定义,重点是因果诊断或症状导向测试.
主要方法:
- 确定了在初级保健中接受PSA测试的患者队列.
- 创建了黄金标准标签,用于使用临床笔记审查和诊断代码进行查.
- 开发了十个可计算的表型定义,并评估了它们的灵敏度,特异性和预测值.
主要成果:
- 一个复合的表型实现了0.99的高正预测值 (PPV) 和合理的灵敏度 (0.82) 识别PSA查.
- 没有一个单一的表型完美平衡了敏感性和PPV.
- 因果诊断和症状导向测试的流行率是显著的.
结论:
- 识别了用于PSA查的基于代码的表型,性能不同.
- 针对病因和症状的测试可以显著影响队列的准确性,如果不考虑.
- 开发了基于EHR的PSA查研究的验证方法.
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