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Updated: May 16, 2025
03:36
Development of Compendium for Esophageal Squamous Cell Carcinoma
Published on: April 12, 2024
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HCDT 2.0:一个高度可靠的药物向数据库,用于实验验证的基因,RNA和途径
Xinying Liu1, Dehua Feng1, Jiaqi Chen1
1School of Biomedical Informatics and Engineering, Kidney disease research institute at the second affiliated hospital, Hainan Engineering Research Center for Health Big Data, Hainan Medical University, Haikou, Hainan, 571199, China.
Scientific data
|April 25, 2025
概括
HCDT 2.0是一个全面的高可信度药物向相互作用数据库,集成用于药物发现和系统药理学应用的多组学数据.
科学领域:
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 药物向相互作用对于理解药物机制和药物发现至关重要.
- 现有的数据库由于数据源和标准的多样性而遭受碎片化.
- HCDT 1.0提供了高度可靠的药物基因相互作用.
研究的目的:
- 介绍HCDT 2.0,一个扩展和标准化的药物向相互作用数据库.
- 整合多组学数据,以全面了解药物相互作用.
- 为系统药理学提供坚实的基础.
主要方法:
- 在HCDT 1.0上扩展,并集成多态数据集成.
- 嵌入的药物基因,药物RNA和药物通路相互作用.
- 综合性通路-基因和RNA-基因调节关系,以及负面的药物向相互作用.
主要成果:
- HCDT 2.0 包含了 1,284,353 个策划的相互作用.
- 包括1,224,774个药物基因,11,770个药物RNA和47,809个药物通路相互作用.
- 具有16,317种药物与疾病的关联和38,653种药物向药物的负面相互作用.
结论:
- HCDT 2.0 解决了药物向相互作用中的数据表示差距.
- 综合框架支持系统药理学应用.
- 能够在药物重定位,不良事件预测和精确瘤学方面取得进展.
