生物信息学分析和PDGFD的实验验证作为急性髓性白血病的有前途的诊断生物标志物
Lulu Yang1, Shuangshuang Ren2, Lijiang Lou1
1Department of Hematology, Ninghai First Hospital, Ningbo, 315600, Zhejiang, China.
Scientific reports
|April 28, 2025
概括
血小板衍生生长因子D (PDGFD) 在急性髓性白血病 (AML) 中被上调,并与预后不佳有关. PDGFD可以作为AML患者的诊断生物标志物和免疫治疗点.
科学领域:
- 血液学 血液学 血液学
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 急性髓性白血病 (AML) 是一种由白血病干细胞 (LSC) 驱动的血液癌症.
- 血小板衍生生长因子 (PDGF) 涉及LSC功能,但它们在AML发展中的作用尚未研究.
- PDGFD是一个特定的PDGF家族成员,其在AML中的作用需要调查.
研究的目的:
- 调查PDGFD在急性髓性白血病 (AML) 发病过程中的作用.
- 评估PDGFD作为AML的潜在诊断和预后生物标志物.
- 探索PDGFD与AML的临床特征,耐药性和免疫治疗的关联.
主要方法:
- 使用R软件和在线工具 (GEPIA2,UCSC-Xena) 来分析TCGA和GTEx数据库中的转录组数据.
- 使用Kaplan-Meier Plotter进行预测分析.
- 通过实时定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) 验证PDGFD表达和临床特征.
- 接收器运行特征 (ROC) 曲线分析用于诊断潜力的评估.
- 功能丰富分析和与免疫细胞的相关性研究.
主要成果:
- 与其他PDGF基因相比,PDGFD在AML中显著上调.
- PDGFD上调与预后不佳,中高细胞遗传风险,NPM1和FLT3-ITD突变相关.
- ROC分析证实了PDGFD在AML中的诊断潜力.
- PDGFD参与和Rap1信号通路,与自然杀手细胞和树突细胞有正相关.
- 针对PDGFD的MiR-203-3p显示出潜在的抗白血病作用.
结论:
- PDGFD是一种有前途的AML诊断和预后生物标志物.
- PDGFD表达水平可以预测患者的结果,并识别高风险个体.
- PDGFD代表了AML的潜在治疗标,特别是在细胞免疫疗法策略中.
