发现传染性循环RNA的多样性:最小寄生虫的新范式?

科学领域:

• 病毒学 病毒学
• 分子生物学分子生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 传染性循环RNAs (circRNAs) 以前被认为是罕见的,主要发生在植物中.
• 最近的高通量转录组分析揭示了各种生态利基中的多种类型的 viroid-like circRNAs.

研究的目的:

• 突出传染性circRNA及其影响的不断扩大的知识.
• 强调需要重新评估有关这些药物的基本假设.
• 为了强调对新发现的circRNAs进行实验验证的必要性.

主要方法:

• 高通量转录基因数据的探索.
• 对序列多样性, ribozymes 和编码蛋白质的生物信息分析.
• 与已知的病毒,RNA病毒和其他循环RNA剂进行比较分析.

主要成果:

• 在各种利基中,已经确定了各种潜在的传染性circRNAs.
• 这些circRNAs的尺寸, ribozyme含量,编码的蛋白质和潜在宿主各不相同.
• 这一发现模糊了 viroids 和 RNA 病毒之间的界限,其中一些编码了依赖 RNA 的 RNA 聚合酶.
• 已发现类似于病毒的circRNAs在真菌中复制并引起症状,其中一些是非常小的复制品.

结论:

• 发现各种传染性circRNAs需要在理解最小寄生虫方面进行范式转变.
• 由于水平基因转移和重组,分类学分类具有挑战性.
• 病原性和宿主范围需要广泛的实验验证.
• 这些药物可能代表了以前未被识别的生物危害,因此需要进一步的特征化工作.