在家禽垃圾中微生物群和耐药性-受精和未受精的农业土壤

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 农业科学 农业科学
• 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性

背景情况:

• 禽类垃圾是一种常见的农业肥料,可以含有抗微生物残留物,抗微生物耐药细菌 (ARB) 和抗微生物耐药基因 (ARG) 由于在家禽生产中使用抗微生物.
• 农业中家禽垃圾的广泛应用引发了人们对ARB和ARG在土壤生态系统中的潜在传播的担忧.

研究的目的:

• 调查家禽垃圾应用对土壤微生物群和耐药性的影响.
• 评估农业土壤中ARB和ARG的存在和多样性,这些土壤是用家禽垃圾受精的.

主要方法:

• 从园艺农场的受肥和未受肥地块收集了土壤样本.
• 使用16S rRNA测序分析了微生物组的组成.
• 使用选择性培养方法分离了耐药细菌菌株,并通过PCR识别了ARG.

主要成果:

• 养子肥显著改变了土壤微生物组的结构和组成,增加了阿尔法多样性和丰富性.
• 肥沃的土壤显示出更高的Bacillota的丰度. 总共有62种耐药菌株被分离出来,其中23种具有临床相关性的菌株携带ARG (例如,诺基诺和β-乳酸盐耐药基因).
• 检测到1类和2类整合子相关基因. 值得注意的是,在受精和未受精的土壤中的细菌中发现了罕见的ARG,这表明了复杂的抗体动态.

结论:

• 养家禽垃圾应用将ARB和ARG引入农业土壤,可能会改变土壤微生物群.
• 这些发现强调了ARB和ARG在农业环境中传播的风险,这些风险可以通过环境因素进一步传播.
• 在受精和未受精的土壤中存在ARG,突出了控制ARB传播的挑战,并使实地研究设计复杂化.