整个小鼠大脑的同步辐射基于断层扫描与亚微米的voxels:增强交互式大脑地图与Terabyte数据的大脑地图

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 生物医学成像技术 生物医学成像技术
• 同步子辐射的辐射

背景情况:

• 以细胞分辨率对小鼠大脑进行3D可视化对于理解神经结构至关重要.
• 现有的成像技术在全脑分析的视野和数据大小方面存在局限性.

研究的目的:

• 介绍一个扩展场的X射线微断层成像方法,用于整个小鼠大脑成像.
• 重建和处理一个多特拉字节的数据集,以增强解剖细节.
• 为了使研究人员能够获得高分辨率的大脑数据.

主要方法:

• 利用基于同步子辐射的X射线微图学,具有扩展的视野.
• 获取了4495个投影,并重建了15000^3个voxel的体积.
• 执行了对艾伦鼠标大脑共同坐标框架v3.3的非刚性注册.
• 存储在公共存储库中的数据,为在线观看者提供层次格式.

主要成果:

• 成功地用同位素细胞分辨率成像了一个整个小鼠大脑.
• 创建了一个3.3-特拉沃克塞尔数据集,显著改善了3D解剖学分辨率.
• 开发了一种用于大规模微观断层扫描数据的处理管道.
• 通过Neuroglancer和siibra-explorer等在线平台启用数据访问和可视化.

结论:

• 同步龙X射线显微断层扫描是一种强大的高分辨率全脑成像工具.
• 开发的方法促进了大规模神经成像数据集的分析和可访问性.
• 这项工作显著增强了现有的老鼠大脑图谱,提供了前所未有的3D细节.