确定关键的细胞外蛋白质作为甲状腺眼病中的潜在生物标志物
Shasha He1, Han Nie2, Xiangbao Yin3
1Department of Endocrine and Metabolism, The First Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China.
PloS one
|April 29, 2025
概括
这项研究确定了甲状腺眼病 (TED) 的潜在生物标志物. 皮表皮生长因子受体 (EGFR),CD44和CXCL8显示出早期诊断和理解TED病变的前景.
科学领域:
- 眼科医生 眼科 眼科
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 甲状腺眼病 (TED) 是一种普遍存在的自身免疫轨道疾病.
- 早期诊断和有效治疗TED仍然是全球性的挑战.
- 体液中的细胞外蛋白质可以作为TED的诊断指标.
研究的目的:
- 通过生物信息学来识别TED的细胞外蛋白和潜在生物标记物.
- 阐明细胞外蛋白在TED病原发生中的作用.
主要方法:
- 获得的基因表达总线 (GEO) 数据用于TED表达特征.
- 选了具有差异表达基因 (EP-DEGs) 的细胞外蛋白.
- 使用基因本体学 (GO) 和KEGG路径分析来确定EP-DEG的功能和路径.
- 使用ROC曲线构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络并评估了使用ROC曲线的诊断潜力.
主要成果:
- 确定了102个EP-DEG,揭示了细胞外基质的丰富,受体-连接体活性,细胞因子-受体相互作用和补充/凝血级联.
- 欧洲议会-DEG PPI网络涉及78个节点和233个边缘.
- 发现了21种与EGFR相互作用的细胞外蛋白,其中EGFR,CD44和CXCL8具有显著的诊断潜力 (AUC>0.7).
结论:
- EGFR,CD44和CXCL8被确定为甲状腺眼病的潜在生物标志物.
- 这项研究为理解TED的病变产生提供了理论基础.
