杜克老鼠大脑地图:MRI和光片显微镜对老鼠大脑的立体学地图

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 生物成像是一种生物成像.
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 脑图集对于标准化神经科学数据至关重要.
• 对于整个小鼠大脑,覆盖宏观到单细胞尺度的全面的3D立体立体学图书馆以前是不可用的.
• 现有的地图集往往缺乏详细分析所需的分辨率或全面覆盖.

研究的目的:

• 为了创建一个高分辨率的,整个大脑的3D立体图解大 atlas 的小鼠大脑.
• 为整合各种神经科学数据建立一个共同的空间框架.
• 为了提高现有的老鼠大脑地图的准确性和实用性.

主要方法:

• 从注射固定小鼠大脑获取15微米分辨率的扩散张力图像.
• 通过扩散张力成像生成多个3D卷,突出显示细胞架构.
• 照明板图像的联合注册和映射到微型计算机断层扫描以实现蜂和地标集成.
• 登记艾伦参考地图,以纠正扭曲,并与新的立体学空间保持一致.

主要成果:

• 开发了一个多级 (13TB) 3D立体立体毒性小鼠大脑图谱.
• 实现了在小鼠大脑的扩散张力成像中报告的最高分辨率.
• 成功地将宏观和单细胞级数据集成到统一的空间参考框架中.
• 在新的立体学空间内纠正了艾伦参考地图中的几何扭曲.

结论:

• 新的地图集为神经科学界提供了关键的资源.
• 允许在小鼠中无集成分子,结构和功能数据.
• 促进对不同研究和模式进行比较分析和数据共享.