在四个不同的qPCR平台上,ScreenFire HPV RS Zebra BioDome试验的分析性能
Jun Wang1,2, Godwin Imade3, Alani S Akanmu4
1Department of Preventive Medicine, Division of Cancer Epidemiology and Prevention, Feinberg School of Medicine, Northwestern University, Chicago, USA. j-wang4@northwestern.edu.
Infectious agents and cancer
|April 30, 2025
概括
屏幕火HPV斑马生物测试显示,在多个qPCR平台上检测高风险的人类乳头瘤病毒 (hrHPV) 的高度一致. 这项创新技术可以在没有新设备成本的情况下,在资源较少的环境中提高HPV检测.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 病毒学 病毒学
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 子宫癌主要是由高危人乳头瘤病毒 (hrHPV) 引起的,在低收入和中等收入国家 (LMICs) 的妇女中影响不成比例.
- 在资源有限的环境中,迫切需要可访问,快速和经济高效的HPV测试解决方案.
- 阿提拉生物系统开发了ScreenFireHPV风险分层 (RS) 试验,以识别四个致癌风险组中的13种hrHPV类型,采用创新的防污染Zebra BioDome格式.
研究的目的:
- 在多个实时PCR平台上评估ScreenFire HPV Zebra BioDome试验的分析性能.
- 为了评估测试在检测hrHPV及其风险分层组在不同的qPCR仪器的一致性.
- 为了确定该试验是否适合在低资源环境中使用.
主要方法:
- 173名尼日利亚女性患有宫癌的DNA样本使用ScreenFire HPV Zebra BioDome试验进行了测试.
- 试验同时运行在四个实时PCR平台上:Atila Portable iAMP-PS96,Atila Powergene9600 Plus,Thermo Fisher QuantStudio-7和BioRad CFX-96. 这四个实时PCR平台上进行了试验.
- 计算了总体协议率和未加权的kappa值,以比较平台性能.
主要成果:
- 在所有测试平台上观察到高的总体同意率,kappa值表明了很好的一致性 (例如,Atila iAMP-PS96与Thermo Fisher QuantStudio-7的96.5%同意,kappa0.95).
- 对于HPV16和四个hrHPV风险分层组的协议率在各个平台上始终超过98.3%.
- 阿提拉Powergene9600 Plus表现出强的性能,与Thermo Fisher QuantStudio-7.7相比,其整体一致性为98.8%.
结论:
- 屏幕火HPV斑马生物圈试验显示,在四个不同的qPCR平台上对hrHPV检测和风险分层具有很高的一致性.
- 这种创新的,防污染的格式显示出在低资源环境中广泛采用的潜力.
- 该技术可能有助于增加HPV测试的普及率,而无需额外投资新的实验室设备.
