mvh:一个R工具,可以从公开可用的样本图像中组装和组织虚拟草本库
Thais Vasconcelos1,2, James D Boyko1,3
1Department of Ecology and Evolutionary Biology University of Michigan Ann Arbor 48109 Michigan USA.
Applications in plant sciences
|May 1, 2025
概括
一个新的R包,mvh (我的虚拟草本馆),允许研究人员轻松搜索和下载草本馆样本图像. 该工具简化了用于生物多样性研究和数字化趋势分析的虚拟草本馆组装.
科学领域:
- 生物多样性研究的研究.
- 数字植物学数字植物学
- 草本科学 草本科学 草本科学
背景情况:
- 在成像草本体标本的进步增加了它们在生物多样性研究中的实用性.
- 需要用户友好的工具来在个人设备上创建定制的草本馆图像集.
研究的目的:
- 为了介绍R包mvh (我的虚拟草本馆).
- 为搜索和下载草本馆标本元数据和基于分类或地理位置的图像提供功能.
主要方法:
- mvh 软件包是使用 R 编程语言开发的.
- 通过搜索50种血管植物物种和50个陆地坐标的元数据来测试功能.
- 评估了下载成功率.
主要成果:
- mvh包成功搜索了指定的类型和坐标的元数据.
- 下载功能实现了99%的成功率,在293张图像中检索了291张.
- 讨论了为数不多的下载失败的潜在原因.
结论:
- mvh包简化了虚拟草本馆的创建和组织.
- 该工具促进了新的经验研究和对数字化趋势的分析.
- 可访问性取决于互联网连接.


