基于甲基化的测试用于诊断良性和恶性黑色素细胞瘤

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子诊断学 分子诊断
• 皮肤病理学 皮肤病理学

背景情况:

• 准确的黑色素瘤诊断对于患者的生存至关重要.
• 黑色素瘤和瘤之间的形态差异化对病理学家来说可能是具有挑战性的,特别是在早期或不那么明显的病例中.
• 需要新的诊断标记物来改善黑色素瘤检测.

研究的目的:

• 为了识别DNA甲基化变化,区分黑色素瘤和瘤.
• 开发和验证用于黑色素瘤诊断的甲基化特异定量实时PCR测定 (MS-qPCR).
• 评估MS-qPCR测定在组织和血样本中的诊断性能.

主要方法:

• 采集了145个黑色素瘤和143个瘤FFPE组织样本,以及黑色素瘤患者和健康对照者的血样本.
• 在一个发现集中利用热测序来识别PRAME,CLDN11和SHOX2促进子甲基化作为潜在的生物标志物.
• 开发并验证了基于显著甲基化标记的MS-qPCR试验,在训练,验证和血集上测试了其性能.

主要成果:

• 确定PRAME和CLDN11促进物甲基化是显著的黑色素瘤生物标志物.
• 在MS-qPCR测定中,在区分黑色素瘤与组织中的瘤方面,MS-qPCR测定显示出高精度 (训练组:94.25%的灵敏度,85.56%的特异性;验证组:84.48%的灵敏度,88.68%的特异性).
• 该测试在血样本中显示出有前途 (51.61%的灵敏度,83.78%的特异性) 并可以区分早期黑色素瘤和瘤 (AUC=0.879).

结论:

• 通过MS-qPCR检测PRAME和CLDN11甲基化水平为区分良性和恶性黑色细胞瘤提供了高灵敏度和特异性.
• 使用血样本的MS-qPCR方法是早期黑色素瘤查的一个有希望的,易于实施的策略.
• 该测试有效地区分各种黑色素瘤亚型,包括状和粘膜黑色素瘤.