斑马鱼没有一个calprotectin ortholog

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 生物化学 生物化学
• 进行比较基因组学.

背景情况:

• 作为S100A8和S100A9的异构体,calprotectin对于哺乳动物的先天免疫非常重要,具有抗菌和抗炎作用.
• 了解calprotectin的调节和功能有助于诊断和治疗炎症性疾病和宿主微生物相互作用.
• 以前的研究表明斑马鱼s100a10b是基于序列和表达模式的calprotectin的功能模拟物.

研究的目的:

• 为了调查斑马鱼是否具有与免疫功能融合的calprotectin正方体或对方体.
• 严格评估斑马鱼候选S100蛋白质的抗菌和抗炎活动.

主要方法:

• 生物信息分析以识别斑马鱼S100的正义词和对应词.
• 重组表达和净化四个候选斑马鱼S100蛋白质.
• 在体外检测抗菌活性,通过结构建模进行过渡金属结合部位分析,以及托尔类受体4激活检测.

主要成果:

• 斑马鱼缺乏哺乳动物S100A8和S100A9的 ортолог.
• 包括s100a10b在内的任何测试的斑马鱼S100蛋白都没有显示出与哺乳动物calprotectin相比的抗菌活性.
• 结构建模显示斑马鱼S100复合体中没有预测的抗微生物过渡金属结合点,也没有激活Toll-like受体4.

结论:

• 斑马鱼没有一个calprotectin ortholog.
• 没有发现的斑马鱼S100蛋白具有与哺乳动物calprotectin的抗菌或促炎作用相似的功能.
• 这项研究驳斥了斑马鱼s100a10b作为功能性calprotectin等效的假设.