利用图表审查的表型中的未决病例来增强基于EHR的关联研究
Xinyao Jian1, Dazheng Zhang1, Zehao Yu2
1The Center for Health Analytics and Synthesis of Evidence (CHASE), University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, Philadelphia, PA, USA; Department of Biostatistics, Epidemiology and Informatics, Perelman School of Medicine, The University of Pennsylvania, Philadelphia, PA, USA.
这项研究引入了一种新方法,将算法衍生和临床医生审查的患者数据结合到电子健康记录中. 这种方法提高了疾病关联研究的准确性和效率.
科学领域:
- 生物医学信息学 生物医学信息学
- 临床流行病学 临床流行病学
- 健康 数据科学 数据科学
背景情况:
- 电子健康记录 (EHR) 的表型算法提供了高效的患者分类,但存在错误分类错误.
- 临床医生手动查看图表是黄金标准,但是劳动密集型的,并且仅限于小型患者子集.
- 手动审查中的不确定的表型可以引入第三个类别,使分析复杂化.
研究的目的:
- 开发一种方法来整合算法衍生的二进制表型和临床医生审查的三进制表型从EHR数据.
- 为了提高协会研究的准确性和效率,使用联合表型数据.
- 通过具有成本效益的采样策略,应对罕见病研究中的挑战.
主要方法:
- 提出了一种增强估计方法,将算法衍生的表型 (整个队列) 与图表审查的表型 (子集) 结合起来.
- 为罕见疾病情景实施了具有成本效益和结果依赖的抽样策略.
- 在模拟和现实世界EHR数据中评估了TriCA (三元图表审查的表型综合性成本效益增强估计) 方法.
主要成果:
- 与模拟中的随机抽样相比,增强方法提高了高达28.3%的平均平方误差.
- 与仅使用图表审查的表型相比,观察到高达33.3% (ADRD数据) 和50.8% (SBCE数据) 的效率增长.
- 在模拟和现实应用中证明了统计效率的提高和不偏见的估计.
结论:
- 拟议的TriCA方法有效地集成了基于EHR的关联研究的算法和手动图表审查数据.
- 这种方法提高了统计效率,并提供了公正的估计,超过现有方法.
- 适用于广泛的研究,改善了EHR数据中的风险因素识别.
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