微流体丰富和循环黑色素瘤细胞遗传分析的模型工作流程

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 循环黑色素瘤细胞 (CMCs) 驱动黑色素瘤转移,但由于数量较少和标记物异质性,研究这些细胞具有挑战性.
• 像CellSearch这样的当前方法通过CD146捕获CMC,但可能会错过一些细胞.
• 帕索提克系统提供基于细胞大小和可变形性的标志物不可知丰富,保持细胞活力.

研究的目的:

• 为了比较CellSearch和Parsortix在CMC丰富方面的疗效.
• 开发一个可行的CMC隔离和随后的遗传分析的综合协议.
• 为了证明用于基因分析的标记异性CMC丰富的可行性.

主要方法:

• 用细胞系和患者样本对CMC捕获率进行CellSearch和Parsortix系统的比较分析.
• 开发一种结合Parsortix和CellSearch的双丰富策略,以减少白细胞污染.
• 使用定制抗体尾酒对富化CMC进行表型鉴定.
• 来自转移性阴膜黑色素瘤患者丰富的CMCs的概念验证遗传分析.

主要成果:

• 与CellSearch相比,Parsortix在患者样本中显示出更高的CMC捕获率.
• 双重缩显著降低了白细胞污染,产生了高度纯净的CMC群体.
• 对CMCs的遗传分析确定了关键突变,包括GNAQ p.Q209L,BAP1删除,同染色体8和CDKN2A删除.

结论:

• 一个优化的协议有效地丰富了转移性黑色素瘤患者的可活的循环黑色素瘤细胞.
• 可行的是对标记物无关的丰富,随后进行表型识别和CMCs的遗传分析.
• 这种综合方法为了解黑色素瘤进展和确定治疗点提供了强大的工具.