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Updated: May 9, 2025

Gene Expression Profiling of Infecting Microbes Using a Digital Bar-coding Platform
09:13

Gene Expression Profiling of Infecting Microbes Using a Digital Bar-coding Platform

Published on: January 13, 2016

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将新陈代谢能力纳入高通量分析分析分析中

Amanda Jurgelewicz1,2, Kristen Breaux1, Clinton M Willis1

  • 1Center for Computational Toxicology and Exposure (CCTE), US EPA, Durham, NC, 27709.

Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
|May 3, 2025
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这项研究将代谢酶整合到高通量化学选试验中,揭示了代谢显著改变化学生物活性和雌激素受体激活. 这种方法通过检测代谢物特异性影响来增强化学品风险评估.

科学领域:

  • 毒理学 毒理学 毒理学
  • 化学生物学 化学生物学
  • 药物新陈代谢 药物新陈代谢

背景情况:

  • 高通量选 (HTS) 试验如细胞涂料 (HTPP) 和TempO-Seq (HTTr) 描述化学生物活性和危害.
  • 目前的体外HTS测定缺乏人类或动物的代谢能力,限制了它们对体内效应的预测能力.
  • 评估化学代谢物对于准确的风险评估至关重要.

研究的目的:

  • 用HTS测试评估化学代谢对生物活性的影响.
  • 整合Alginate 代谢酶固定化 (AIME) 平台与HTPP和HTTr试验.
  • 评估乳腺癌细胞系 (VM7Luc4E2) 具有和没有代谢能力的化学生物活性变化.

主要方法:

  • 将AIME平台与细胞绘画 (HTPP) 和TempO-Seq (HTTr) 试验相结合.
  • 使用雌激素受体交换激活试验 (ERTA) 来测量ER激活.
  • 暴露VM7Luc4E2细胞与AIME生成的代谢产物和没有的化学物质.

主要成果:

  • HTPP显示了与增强的雌激素受体 (ER) 激活相关的生物活性度依赖的增加.
  • 在代谢条件下,HTTr检测到更活跃的基因,与增加的ER激活相关.
关键词:
(4-6):新的方法方法新方法方法.细胞油漆 细胞油漆雌激素受体的受体高通量类型的表型分析.高通量转录组学 高通量转录组学异生物代谢的异生物代谢

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  • 观察到ER高信心 (ERHC) 基因签名丰富的代谢诱导的转变,作为ER活动的转录组读取.

    • 结论:

    • 与HTPP和HTTr测试成功集成的AIME平台检测了由于代谢导致的化学生物活性可重复的变化.
    • 将代谢能力纳入HTS测试可以提高化学危害的特征.
    • 这种方法通过识别当前选方法遗漏的代谢物特定生物活性来增强下一代风险评估.