单细胞剖析揭示了保存的分化和部分EMT程序,协调了头癌的生态系统水平对立性

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 免疫学 免疫学 免疫学

背景情况:

• 头部和部状细胞癌 (HNSC) 具有显著的内异质性的特点.
• 瘤微环境 (TME) 通过复杂的细胞相互作用在HNSC进展中发挥着至关重要的作用.

研究的目的:

• 通过单细胞转录学,在HNSC内定义保存的细胞生态系统.
• 为了阐明恶性上皮细胞和TME之间的交叉声.
• 根据生态系统层面的模式,识别潜在的治疗点.

主要方法:

• 共识非负矩阵因子化 (cNMF) 应用于多位点HNSC单细胞转录组.
• 分区特定的交叉语音分析以确定信号通路.
• 多部件相关性分析,以揭示生态系统层面的模式.

主要成果:

• 确定了六个主要的上皮细胞程序,包括与有利预后相关的分化相关程序 (Epi_Diff) 和与细胞外基质 (ECM) 改造和部分上皮细胞-介质细胞过渡 (EMT) 相关的侵入性程序 (Epi_pEMT).
• 皮_pEMT细胞可能通过与癌症相关的髓状纤维细胞 (mCAF1) 和瘤相关的巨细胞 (TAM(SPP1) 相互作用,形成亲侵入性.
• 通过与NK/T细胞的相互作用,Epi_Diff细胞可能会抑制免疫透,而生态系统层面的分析显示了Epi_Diff和Epi_pEMT,mCAF1和癌症相关纤维细胞 (cCAF) 之间的反向关联,以及TAM(SPP1) 与TAM(C1Q) 和NK/T透的优势.

结论:

• HNSC生态系统是由不同的上皮细胞程序及其与TME的相互作用构成的.
• 侵入性和分化程序之间的平衡,以及特定的免疫细胞亚型,可能会决定疾病的进展.
• 了解这些生态系统动态为HNSC的向治疗提供了潜在的途径.