奥林克和SomaScan蛋白质组学平台之间的相关性在成年人中具有Fontan循环
Ismael Z Assi1, Michael J Landzberg2,3,4, Kristian C Becker1
1Heart Institute, Department of Pediatrics, Cincinnati Children's Hospital, University of Cincinnati College of Medicine, Cincinnati, OH, USA.
高通量蛋白质组学平台 (SomaScan和Olink) 在测量成年人血蛋白质与Fontan循环中显示了中度的相关性. 结果与其他种群一致,表明对产生假设有用,但需要验证.
科学领域:
- 心血管研究研究心血管研究
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 像SomaScan和Olink这样的高通量蛋白质组学平台为心血管疾病提供了新的诊断工具.
- 遗传性心脏病,例如Fontan循环,在蛋白质组学中仍未得到充分研究.
- 索马扫描和奥林克之间的相关性以前没有在Fontan循环的个体中进行评估.
研究的目的:
- 评估从SomaScan和Olink平台获得的血蛋白质测量之间的相关性.
- 评估这些高通量蛋白质组学平台在成年人中具有Fontan循环的实用性.
主要方法:
- 来自Fontan循环的71名成人的血样本使用Olink和SomaScan平台进行了分析,测量了491种蛋白质.
- 斯皮尔曼等级相关系数计算了两个平台之间的绝对蛋白质表达值.
- 蛋白质相关频率与非Fontan队列的现有文献进行了比较.
主要成果:
- 在Olink和SomaScan测量之间观察到一个中等的相关性 (Spearman的rho>0.4为57.2%),具有相当大的变化 (中位数rho=0.457).
- 蛋白质相关性的分布与非Fontan人群研究中报告的分布相似.
- 两种平台都确定了基于性别的蛋白质差异,包括肌素和瘦素,每个平台都检测到独特的两性变态蛋白质.
结论:
- 通过Olink和SomaScan测量到Fontan循环的成年人中的血蛋白相关性表现出广泛的变异性,与其他人群的发现一致.
- 这些蛋白质组学平台对于产生关于Fontan循环中的分子机制的假设有价值.
- 从这些高通量蛋白质组数据中得出的最终结论需要独立验证.
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