生物信息学方法来识别影响慢性阻塞性肺部疾病的isoliquiritigenin的分子标:一项机器学习药理学研究
Sha Huang1,2, Lulu Zhang1,2, Xiaoju Liu2
1The First Clinical Medical College, Lanzhou University, Lanzhou 730000, China.
International journal of molecular sciences
|May 7, 2025
概括
伊索利基基因因 (ISO) 可以通过调节膜巨细胞 (AM) 中的糖解和细胞化来治疗慢性阻塞性肺病 (COPD). 确定和验证了AKT1,IFNG和JUN的关键目标,显示了ISO的目标.
科学领域:
- 肺部医学 肺部医学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 慢性阻塞性肺病 (COPD) 是一种复杂的呼吸系统疾病.
- 膜巨细胞 (AM) 在COPD的发病过程中起着至关重要的作用.
- 在AM中糖解和细胞酶的失调有助于COPD的进展.
研究的目的:
- 为了阐明COPD中isoliquiritigenin (ISO) 的分子机制.
- 通过分析其对AM糖解和细胞分裂的影响,确定ISO的关键治疗标.
- 用生物信息学和分子对接来验证潜在的治疗点.
主要方法:
- 下载并分析了基因表达综合 (GEO) 数据集 (GSE130928,GSE13896).
- 利用权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),差异表达分析和途径丰富分析.
- 来自多个数据库 (TCMSP,CTD,PubChem,GeneCards,MSigDB) 的综合数据,以确定COPD和ISO目标.
- 使用机器学习,MCODE算法和分子对接来识别和验证目标.
主要成果:
- 确定了890个潜在的COPD目标和142个ISO目标.
- 丰富分析揭示了20个关键路径.
- 确定了三个关键目标 - AKT1,IFNG和JUN - 对于ISO对COPD的影响至关重要,即调节AM中的糖解和细胞.
- 分子对接证实了ISO和这些目标之间的结合相互作用.
结论:
- 伊索利基基因因 (ISO) 证明了对COPD的治疗潜力.
- AKT1,IFNG和JUN被确定为ISO在调节AM功能的关键分子标.
- 这些发现为ISO在COPD治疗中的应用提供了分子基础,并突出了免疫细胞透的作用.
