一种假定的皮奥辛S9的分子和功能分析,具有来自P. chlororaphis subsp aurantiaca PB-St2的内核酶活性

科学领域:

• 微生物学和分子生物学
• 细菌素研究研究 细菌素研究
• 基因组学和蛋白质组学

背景情况:

• 皮奥辛是特定于伪单体的细菌素,在细菌间的竞争中发挥作用.
• 在各种环境中 Pseudomonas 种类具有重要意义,包括植物根球,在那里竞争激烈.

研究的目的:

• 识别和描述Pseudomonas chlororaphis亚种中的新型皮奥辛系统. 一个乌兰提亚 PB-St2.2.
• 调查已识别的皮奥辛S9c.的分子和功能性质.
• 评估素S9c在植物相关息地中的潜在生态作用.

主要方法:

• 基因组挖掘和序列分析以确定皮奥辛系统.
• 对细菌素生产和活性谱的表型查.
• 分子克隆,表达和净化皮奥辛S9c细胞毒性蛋白质.
• 质谱测量用于蛋白质识别和内核酶活性检测.

主要成果:

• 在P. chlororaphis亚种中鉴定了三种S9类,一种S3类和一种R类皮奥辛系统. 一个乌兰提亚 PB-St2.2.
• 皮奥辛S9c对相关的Pseudomonas物种表现出狭窄谱的杀菌活性.
• 纯化的皮奥辛S9c蛋白作为一种金属依赖的内核酶,其最小抑制度为12.5μg/ml.
• 皮奥辛S9c系统存在于多种P. chlororaphis亚种中. 从不同的植物宿主中分离出来的aurantiaca菌株.

结论:

• 皮奥辛S9c是一种新型异型,属于I类DNase (H-N-H) 家族,通常在P. chlororaphis菌株中发现.
• 标志性的皮奥辛S9c显示出强大的抗菌活性,对相关的Pseudomonas物种.
• 皮奥辛S9c可能有助于P. chlororaphis亚种的树根竞争力. 在植物相关环境中的aurantiaca.