通过转录学学结合生物信息学和机器学习方法来识别Npas4作为CICI的生物标志物
Zhenyu He1, Huanhuan Ma1, Yu Zhang1
1Gansu University Key Laboratory for Molecular Medicine & Chinese Medicine Prevention and Treatment of Major Diseases, Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou, China; Key Laboratory of Dunhuang Medical and Transformation, Ministry of Education of The People's Republic of China, Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou, China.
Experimental neurology
|May 8, 2025
概括
化疗引起的认知障碍 (CICI) 影响了许多癌症幸存者. 这项研究确定了Npas4作为CICI的潜在早期诊断基因,为研究提供了一条新的途径,并改善了患者的治疗结果.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 神经科学是一个神经科学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 化疗是癌症治疗的基石,但它可能导致幸存者的认知障碍显著.
- 化疗诱导的认知障碍 (CICI) 对幸存者的生活质量产生负面影响.
- 对于CICI,需要可靠的早期诊断标记物.
研究的目的:
- 为了确定化疗诱导认知障碍 (CICI) 的新型诊断基因.
- 探索与CICI相关的生物功能和潜在的治疗点.
- 建立一个强大的小鼠模型来研究CICI.
主要方法:
- 建立了一个CICI的小鼠模型.
- 利用生物信息学,机器学习和转录组测序来选差异表达基因 (DEG).
- 应用权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),基因本体学 (GO),基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 和基因组丰富分析 (GSEA).
主要成果:
- 通过对机器学习方法的综合分析,确定了Npas4作为CICI的关键诊断基因.
- 使用接收器操作特征 (ROC) 分析验证了Npas4的诊断值.
- 发现了Npas4的潜在生物功能,并探索了相关的化学物质.
结论:
- Npas4作为化学疗法诱导认知障碍 (CICI) 的有前途的早期诊断生物标志物.
- 这项研究为CICI开发新的诊断策略提供了理论基础.
- 对Npas4的进一步调查可能会为CICI带来新的治疗干预措施.
关键词:
生物标志物生物标志物CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICI CICU CICU CICU CICU CICU CICU CICU拉索·拉索 (Lasso) 是一个分子结构分子结构.这是一个Npas4pas.这就是为什么RF是RF.在SVM-REF中,我们可以使用SVM-REF.
