在患有急性呼吸道感染的儿童中,针对呼吸道病原体的下一代测序表征
Chunhong Li1, Xinghong Zhang2, Panyan Liu1
1Infection Diagnosis Center, Guangxi KingMed Diagnostics, Nanning, People's Republic of China.
BMC infectious diseases
|May 9, 2025
概括
口腔囊片的目标下一代测序 (tNGS) 为儿童急性呼吸道感染 (ARI) 提供了全面的诊断方法. 与传统技术相比,这种方法显著改善了病原体检测,有助于更好的治疗和预防策略.
科学领域:
- 儿童传染病 儿童传染病
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 急性呼吸道感染 (ARIs) 是一个重大的全球健康挑战,特别是对于婴儿和幼儿来说,与高发病率和死亡率有关.
- 目标下一代测序 (tNGS) 是一种新兴的,快速且具有成本效益的诊断工具,用于识别广泛的呼吸道病原体.
研究的目的:
- 这项研究是第一个使用tNGS的口腔囊片来诊断和治疗儿科患者的ARI.
- 识别导致ARI的细菌和病毒病原体的频谱,并分析人口变异.
- 评估tNGS在ARI诊断和治疗中的临床实用性.
主要方法:
- 从336名被诊断患有ARI的儿科患者中收集了口腔膜和唾液样本.
- 用tNGS分析样品,并并行地使用唾液培养物来识别病原体.
- 对临床数据进行了回顾性分析,以评估tNGS的诊断和治疗应用.
主要成果:
- tNGS确定了38种潜在的病原体 (15种细菌,10种病毒,13种病毒亚型),检测率为100%.
- 主要的病原体包括肺炎性链球菌,斯坦诺托福蒙纳斯马尔托菲利亚和人类腺病毒.
- 与唾液培养 (53.2%) 相比,tNGS的检测率显著更高 (100%),并揭示了特定年龄的病原体分布.
结论:
- 与传统方法相比,使用口腔大 swab 的tNGS显著提高了对ARI的病原体检测.
- 这些发现支持tNGS在改善诊断,向治疗和有效预防ARI方面的潜力.
- tNGS为ARI监测和临床管理提供了一个有价值的工具.
