与1型糖尿病中高血糖相关的CpG甲基化变化发生在血管性球和视网膜基因位点
Xiaojian Shao1,2, Sophie Le Fur3, Warren Cheung4
1Digital Technologies Research Center, National Research Council Canada, Ottawa, ON, K1A 0R6, Canada. Xiaojian.Shao@nrc-cnrc.gc.ca.
1型糖尿病 (T1D) 的高血糖与DNA甲基化变化有关. 这些表观遗传变化可能解释T1D长期并发症,如脏和眼睛疾病.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 基因组学就是基因组学.
- 糖尿病研究 糖尿病研究
背景情况:
- 慢性高血糖是1型糖尿病 (T1D) 中微血管和心血管并发症的主要驱动因素.
- 表观遗传修饰,特别是DNA甲基化,受到高血糖等环境因素的影响,可能会导致T1D并发症.
研究的目的:
- 研究T1D年轻患者的动态DNA甲基化变化和慢性高血糖之间的关系.
- 确定特定的基因组部位,其中甲基化变化与高血糖相关,并可能导致T1D并发症.
主要方法:
- 采集了112名T1D患者在诊断时和3年后的血液样本.
- 利用全基因组的双硫酸盐测序来分析数百万个CpG的DNA甲基化变化.
- 使用线性回归模型,调整共变量,以将纵向DNA甲基化动态与平均HbA1c水平相关联.
主要成果:
- 确定了815个CpG位点,其中DNA甲基化变化与平均HbA1c水平相关 (p < 1e-4).
- 超过98%的这些CpG位于促进体区域之外,富含CpG海岸和免疫细胞可访问的染色体.
- 在36个强烈相关的位置 (p < 5e-6) 中,16个涉及的基因或与血管生成,血管发育或冠状动脉疾病相关的非编码序列.
结论:
- 血液中的纵向DNA甲基化变化与T1D的慢性高血糖相关.
- 确定了新的基因组位点,高血糖诱导的甲基化可能会导致T1D相关的微血管和心血管并发症.
- 这些发现为潜在的表观遗传机制提供了洞察力,这些机制是T1D长期并发症的基础.
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