使用等离子体蛋白质组对肺高血压患者进行集群
Athénaïs Boucly1,2, Shanshan Song1, Merve Keles1
1Imperial College London, London, United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland.
概括
肺高血压血蛋白质分析确定了四个不同的患者群,存活率各不相同. 这些集群与PDGF和TGF-β等分子通路相关,可以指导向治疗.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 心脏病学 心脏病学
背景情况:
- 肺高血压 (PH) 分类指导治疗,但分子洞察力可以改进治疗选择.
- 了解PH的分子驱动因素对于个性化医学至关重要.
研究的目的:
- 通过使用血蛋白质基因分析来识别肺高血压的不同分子亚型.
- 将这些亚型与临床结果和潜在的治疗目标相关联.
主要方法:
- 在470名PH患者,136名疾病对照和59名健康对照中测试了血蛋白水平,使用了SomaScan 7K平台.
- 利用7288种蛋白质的无监督聚类 (在UMAP维度上的k-平均值) 来识别PH特异性聚类.
- 在独立的英国和法国队列中验证了集群区别和临床相关性.
主要成果:
- 鉴定了156种血蛋白,使PH与对照蛋白区分开来,形成4个不同的集群.
- 集群表现出明显不同的5年生存率 (78%,62%,44%,33%).
- 在验证队列中证实集群与生存的关联;在特定集群中确定了PDGF和TGF-β途径失调.
结论:
- 血蛋白质组分析有效地将PH患者分为4个新的集群,独立于当前的临床分类.
- 这些蛋白质组集群可以作为治疗学生物标志物,用于开发向疗法.
- 潜在的治疗策略可以专注于已识别的PDGF和TGF-β通路.
