识别与细胞死亡相关的编程基因,并使用单细胞和转录组分析在口腔状细胞癌中构建预后模型
Yongheng Li1, Yang Yu2, Shaonan Hu3
1Department of Stomatology, Qunli Branch, The First Affiliated Hospital of Harbin Medical University, 2075 Qunli Seventh Avenue, Harbin, 150001, Heilongjiang Province, China. 122304546@qq.com.
Discover oncology
|May 9, 2025
概括
这项研究确定了与口腔状细胞癌 (OSCC) 编程细胞死亡相关的五个基因特征. 这种预后模型有助于对OSCC患者进行风险分层和个性化治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 口腔状细胞癌 (OSCC) 具有显著的死亡率和不良预后.
- 与细胞死亡相关的编程基因对于理解OSCC进展和治疗至关重要.
研究的目的:
- 用编程细胞死亡相关基因识别和验证OSCC的预后基因签名.
- 探索这种特征的潜在临床应用,用于风险分层和个性化治疗.
主要方法:
- 对差异表达基因 (DEG) 的TCGA和GSE41613数据集中的RNA测序数据的分析.
- DEGs与编程细胞死亡相关基因的交叉,其次是蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建.
- 开发和验证使用考克斯回归,卡普兰-梅尔分析和ROC曲线的五基因预后模型.
主要成果:
- 一个五基因的预后签名 (MET,GSDMB,KIT,PRKAG3,CDKN2A) 被确定并验证.
- 该模型在1,2和3年生存期 (AUC>0.6) 中表现出强大的预测性能.
- 单细胞分析表明,基因表达在具有显著细胞间通信的树皮和上皮细胞中占主导地位.
结论:
- 一种基于编程细胞死亡基因的OSCC新型五基因预后签名已经开发和验证.
- 这种特征有望在OSCC患者风险分层和个性化治疗中得到临床应用.


