在Brassica juncea中与病原发生相关的蛋白1基因家族的全基因组识别和表征

科学领域:

• 植物分子生物学 植物分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 植物防御机制 植物防御机制

背景情况:

• 相关蛋白1 (PR1) 家族蛋白质对于植物对病原体的防御至关重要.
• 在Brassica juncea中,PR1基因的特定作用和基因组组织在很大程度上仍未被探索.

研究的目的:

• 为了进行全基因组识别和表征PR1基因家族在Brassica juncea.
• 分析B. juncea PR1基因的遗传学关系,基因结构,保存的基因和染色体分布.

主要方法:

• 在B. juncea数据库中对PR1基因进行全基因组识别.
• 使用保存的图案和基因结构进行了基因学分析.
• 域分析以确定保存的功能区域.
• 染色体映射以确定基因定位.
• 发起人分析以预测监管要素.
• 在各种压力和荷尔蒙治疗下表情分析.

主要成果:

• 在B. juncea基因组中确定了43个PR1基因家族成员 (BjuPR1).
• 遗传学分析将BjuPR1蛋白质分为五个群体,揭示了保存的动机 (例如,动机2) 和基因结构 (1-5个编码的外显子).
• 确定了包括CAP,caveolin-binding motif (CMD) 和CAPE cleavage motif在内的保存域. 基因分布在13个染色体中,其中的促进子区域含有应激和荷尔蒙反应元素. 在生物,非生物和激素治疗下观察到不同的表达模式.

结论:

• 这项全面的分析提供了对Brassica juncea.中PR1基因家族的基本理解.
• 鉴定到的基因,它们的调节元件和表达模式为未来的功能验证和作物改进策略提供了有价值的目标.