一种深度学习和分子建模方法,将Cangrelor重新用作尼帕病毒的潜在抑制剂
Levin John1,2, Leona Dcunha1, Mukhtar Ahmed3
1Centre for Integrative Omics Data Science, Yenepoya (Deemed to be University), Mangalore, 575018, Karnataka, India.
Scientific reports
|May 12, 2025
概括
研究人员确定了Cangrelor,一种心血管药物,作为尼帕病毒 (NiV) 的潜在抗病毒治疗方法. 这种重新设计的药物与NiV L蛋白强烈结合,这表明它可以抑制病毒复制并对抗动物传播疾病的爆发.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 计算生物学 计算生物学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 动物传播疾病,包括尼帕病毒 (NiV) 感染,构成严重的全球健康威胁,由环境变化加剧.
- 尼帕病毒是由蝙蝠传播的,人类死亡率高,缺乏特定的抗病毒治疗或疫苗.
- 准NiVRNA依赖RNA聚合酶 (L) 是抑制病毒复制的一个有前途的治疗策略.
研究的目的:
- 通过药物重新定位,识别现有的FDA批准的药物,可以有效地结合和抑制尼帕病毒L蛋白.
- 利用深度学习和分子模拟来选和验证针对NiV的潜在抗病毒化合物.
主要方法:
- 开发了一种基于注意力的深度学习模型,以预测NiV L蛋白的活性部位与药物结合的疗效.
- 大约有500种FDA批准的药物被选,以确定它们与NiV L蛋白的结合亲和力.
- 用分子动力学模拟来评估有希望的候选药物的稳定性和结合能.
主要成果:
- 康格洛尔是一种抗血小板药物,与雷梅西维尔相比,其与NiV L蛋白的结合亲和力更强 (滑动得分:12.30 kcal/mol).
- 分子动力学模拟证实了Cangrelor与NiV L蛋白的稳定结合,结合能量为-181.84 kcal/mol,RMSD为3.54 Å.
- 分析表明,Cangrelor与NiV L蛋白的活性部位的相互作用可能会破坏病毒RNA合成和复制.
结论:
- 康格罗尔成为针对尼帕病毒感染的强有力的药物候选者,因为它与病毒L蛋白的强烈和稳定的相互作用.
- 这些发现表明,康格洛尔可能有效地抑制NiV复制,提供了潜在的新治疗途径.
- 建议进行进一步的体内研究,以验证Cangrelor作为尼帕病毒抗病毒剂的有效性.
