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Updated: May 12, 2026
Identification of Circular RNAs using RNA Sequencing
Published on: November 14, 2019
对与心房相关的循环RNA进行生物信息学分析,并将其作为预测生物标志物的评估
Manman Wang1,2, Yuanyuan Chen1, Weiwei Yang3
1Shandong Provincial Key Medical and Health Discipline of Cardiology, Jining Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Cardiovascular Diseases, Jining Key Laboratory of Precise Therapeutic Research of Coronary Intervention, Department of Cardiology, Affiliated Hospital of Jining Medical University, Jining, Shandong, China.
这项研究在心房患者中鉴定了3338个差异表达的循环RNA (circRNA),揭示了8个特定的circRNA作为AF诊断的潜在生物标志物. 这些发现提升了对心血管疾病中circRNAs的理解.
科学领域:
- 心血管生物学 心血管生物学
- 分子遗传学 分子遗传学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 循环非编码RNAs (circRNAs) 越来越多地被认为是它们在人类疾病中的作用.
- 在心房动 (AF) 中circRNAs的特定参与仍然在很大程度上未被探索.
- 这项研究解决了关于AF病变发生过程中circRNAs的知识差距.
研究的目的:
- 通过生物信息学分析识别与心房相关的循环RNA (circRNAs).
- 构建一个竞争的内源RNA (ceRNA) 网络,涉及AF相关的circRNA,miRNA和mRNA.
- 为了确定潜在的circRNA生物标志物用于AF诊断.
主要方法:
- 分析了AF患者的左心房附属体样本和鼻节律 (SR) 控制的CircRNA测序数据.
- 在AF和SR组之间确定了差异表达的circRNAs (DEcircRNAs).
- 进行了功能丰富分析 (GO和KEGG) 和ceRNA网络构建.
主要成果:
- 在AF患者中共鉴定出3338个DEcircRNA (2147个上调,1191个下调).
- 构建了一个包含16个DEcircRNA,11个DEmiRNA和15个DEmRNA的ceRNA网络.
- 八种circRNAs (circRNA_00324,circRNA_17225,circRNA_16305,circRNA_10233,circRNA_05499,circRNA_03183,circRNA_14211,circRNA_18422) 显示出它们可能成为AF的诊断生物标志物.
结论:
- 成功构建了一个AF相关的ceRNA网络.
- 确定了8种特定的circRNAs作为心房动的有前途的预测生物标志物.
- 这些发现有助于了解AF的分子机制,并提供潜在的诊断工具.
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