在冠状病毒相关的病毒性败血症中,与铁死相关的基因的表达和诊断值
Yidan Zhang1, Shaoduo Wu1, Xiaoyan Li2
1Department of Respiratory and Critical Care Medicine, Third Hospital of Shanxi Medical University, Shanxi Bethune Hospital, Shanxi Academy of Medical Sciences, Tongji Shanxi Hospital, Taiyuan, Shanxi, China.
Frontiers in medicine
|May 15, 2025
概括
这项研究确定了IL1-β和HMOX1作为冠状病毒相关病毒性败血症中关键的铁化相关基因. 这些基因有潜力成为这种严重疾病的诊断生物标志物.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 分子生物学分子生物学
- 传染病病理学 传染病病理学
背景情况:
- 冠状病毒相关的病毒性败血症是一个重大的临床挑战.
- 了解分子机制,包括铁亡,对于诊断和治疗至关重要.
- 关于这种情况中特定的铁亡相关基因的知识有限.
研究的目的:
- 为了研究与冠状病毒相关的病毒性败血症中与铁亡相关的基因的差异表达.
- 评估这些基因作为潜在生物标记物的诊断价值.
- 为了确定这种疾病的发病过程中的关键分子参与者.
主要方法:
- 对基因表达数据集 (GSE164805,GSE199816) 的分析,以确定差异表达基因 (DEG).
- DEG与ferroptosis基因数据集的交叉,以精确确定相关的基因.
- 基因本体学 (GO) 和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 途径分析,免疫细胞透的CIBERSORT,以及蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络建设以识别枢纽基因.
- 在患者样本中对候选生物标志物 (IL1-β和HMOX1) 的临床验证.
主要成果:
- 确定了189个与铁亡相关的DEG,在铁亡,氧化应激和HIF-1信号通路中显著丰富.
- 鉴定出IL1-β和HMOX1是参与铁亡的枢纽基因.
- 与对照组相比,在冠状病毒相关的病毒性败血症患者中,IL1-β和HMOX1的表达减少.
- IL1-β和HMOX1显示出显著的诊断潜力,接收器操作特征曲线 (AUROC) 下面的区域值分别为0.892和0.765.
结论:
- IL1-β和HMOX1被确定为冠状病毒相关的病毒性败血症中关键的铁亡相关的枢纽基因.
- 这些基因作为疾病的有效诊断生物标志物.
- 这些发现表明IL1-β和HMOX1是潜在的治疗点,需要进一步调查.
