在使用SWATH-MS的ME/CFS患者的免疫细胞上的定量蛋白质学

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.

背景情况:

• 肌痛性脑筋炎/慢性疲劳综合征 (ME/CFS) 病理生理学越来越多地通过"omics"研究来理解.
• 蛋白质组学为ME/CFS等复杂疾病提供了分子洞察力.

研究的目的:

• 提供一个全面的SWATH-MS工作流程,用于定量蛋白质基因分析.
• 用外围单核血细胞调查ME/CFS中的蛋白质基因变化.

主要方法:

• 对SWATH-MS.的样本准备,数据采集和数据分析的详细描述.
• 从预分离的酸生成一个光谱库.
• 使用5600+ TripleTOF质谱仪获取数据独立获取 (DIA) 数据集.

主要成果:

• 基于图书馆 (PeakView/MarkerView) 和没有图书馆 (DIA-NN) 的数据分析管道的介绍.
• 在ME/CFS中进行定量蛋白质分析的完整工作流程的演示.

结论:

• 描述的SWATH-MS工作流程为ME/CFS蛋白质组研究提供了一个强大的方法.
• 这种工作流程有助于识别ME/CFS的潜在蛋白质生物标志物.