转录组分析了感染SARS-CoV-2Delta变种的幸存者和不幸存者患者之间的差异表达
Vlasov Ivan1, Usenko Tatiana2,3, Panteleeva Alexandra2,3
1National Research Center «Kurchatov Institute», Moscow, Russian Federation. invlasov@mail.ru.
Scientific reports
|May 15, 2025
概括
在严重的COVID-19患者中识别像ISG15这样的关键基因可以预测结果. 了解外周血液单核细胞 (PBMC) 中的这些基因表达,有助于确定重症患者的生存机会.
科学领域:
- 免疫基因组学是什么
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 严重的COVID-19呈现出复杂的病理过程.
- 确定严重病患者的预后因素至关重要.
- 需要进一步调查SARS-CoV-2德尔塔菌株的影响.
研究的目的:
- 在严重的COVID-19患者中识别差异表达的基因.
- 为了将基因表达与临床结果相关联 (生存与非生存).
- 阐明特定基因在宿主对SARS-CoV-2的反应中的作用.
主要方法:
- 对外围血液单核细胞 (PBMC) 的比较RNA测序 (RNA-seq).
- 从严重的COVID-19患者 (Delta菌株) 的转录组数据分析.
- 在30天内区分幸存者和非幸存者之间的基因表达特征.
主要成果:
- 确定了与"病毒过程的负调节"和"免疫反应的负调节"相关的差异表达基因.
- 幸存者表现出关键基因的表达增加:C1QB,C1QA,ISG15,SERPING1,VSIG4,KLRD1,TRPM4和HFE.
- 编码干扰素诱导蛋白质的ISG15基因因其与SARS-CoV-2蛋白酶PLpro.pro的作用和相互作用而被突出.
结论:
- 在PBMC中的基因表达特征可以区分COVID-19患者的结果.
- 上调基因,特别是ISG15,与严重COVID-19的良好预后有关.
- ISG15在抗病毒防御中的作用及其与SARS-CoV-2的相互作用表明了治疗潜力.
