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Updated: Jun 19, 2026

11:14
Primer-Free Aptamer Selection Using A Random DNA Library
Published on: July 26, 2010
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对阿普坦酶序列的四重复性倾向的分析
Anne Cucchiarini1, Michaela Dobrovolná2,3, Václav Brázda2,3
1Laboratoire d'Optique et Biosciences, Ecole Polytechnique, CNRS, INSERM, Institut Polytechnique de Paris, 91120 Palaiseau, France.
Nucleic acids research
|May 16, 2025
概括
亚体,DNA或RNA分子,经常形成G-四重复 (G4) 结构,这是一个经常被忽视的发现. 这项研究揭示了大量的体具有G4图案,需要重新评估它们的结构潜力.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 胺是核酸分子,对特定目标具有很高的亲和力.
- G-四重复 (G4) 结构是某些体体采用的独特折叠.
- 在合体选择 (SELEX) 过程中G4基因的出现频率尚不清楚.
研究的目的:
- 为了调查G-四重复 (G4) 形成图案在aptamer序列中的流行率.
- 在一个大型的aptamer数据库中分析G4和i-motif倾向.
- 评估预测的G4结构在aptamers的实验验证.
主要方法:
- 从UTexas Aptamer数据库中分析了1400多个阿普塔默序列.
- 使用G4Hunter进行G4和i-motif形成潜力的计算预测.
- 实验验证G4形成对选择的aptamer候选人的验证.
主要成果:
- 预计近1/4的DNA体和1/6的RNA体将形成G4结构.
- 许多G4图案被发现在以前与四重复形成无关的序列中.
- 实验验证确认了G4形成的所有序列的实验验证,G4Hunter得分>= 1.31.
结论:
- 很大一部分的体含有G-四重复形成基因.
- 在体中形成G4的潜力经常被低估或没有报告.
- 这些发现表明,需要重新评估G4倾向性在阿普坦酶序列分析和设计中.

