氨酸酸盐的Riboswitch受到了Escherichia coli中氨酸衍生代谢转化产品的影响

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 代谢调节 代谢调节 代谢调节
• 控制基因表达 控制基因表达

背景情况:

• 带状切换器是调节基因表达的基因元素,以响应特定的代谢物结合.
• 虽然 рибо开关的特异性很高,但它们与更广泛的代谢途径的相互作用仍未得到充分研究.
• 了解细胞代谢转化如何影响 рибо开关功能对于理解基因调节至关重要.

研究的目的:

• 为了研究 lysine-sensing 和 thiamin pyrophosphate (TPP) -sensing riboswitches 在大肠杆菌中的调节机制.
• 为了确定非同源代谢物或它们的代谢副产品是否影响 рибо开关活动.
• 探索氨酸和TPP代谢途径之间的潜在交叉对话,影响 рибо开关功能.

主要方法:

• 在大肠杆菌中 lysine 和 TPP рибо开关调节的表征.
• 对在生长介质中添加 lysine 和 TPP 后基因表达变化的分析.
• 利用基约收藏中的突变菌株来探测代谢依赖性.

主要成果:

• 氨酸和TPP的添加都降低了它们各自的核糖开关调节的mRNA水平.
• 氨酸的添加也显著降低了TPP调节的mRNA,这表明对TPP рибо开关有间接影响.
• 这种间接效应在改变了氨酸降解的突变物中被废除了,这表明氨酸催化剂在TPP合成中发挥了作用.
• 添加TPP并没有影响 lysine riboswitch调节.

结论:

• 氨酸降解产物可能参与TPP生物合成,将氨酸代谢与TPP рибо开关活性联系起来.
• TPP 核子开关可以感知 lysine 水平的变化,这表明它在检测细胞压力方面发挥了更广泛的作用.
• 带状交换机可能表现出超出其直接代谢物标的细胞条件的敏感性.