子过敏组概述和Cor a gRNAs识别方法

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 过敏原研究研究
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 子 (Corylus物种) 营养丰富,但含有13种已知的过敏原 (Cor a),由WHO/IUIS列出.
• 基因组数据使得在低过敏性繁殖中探索子过敏组变异性成为可能.
• CRISPR-Cas9指导RNA (gRNA) 设计对于开发低过敏性子至关重要,但工具有限.

研究的目的:

• 为了研究四种Corylus物种中的过敏性Cor a同类的进化路径.
• 为了识别和表征Cor a过敏原及其在Corylus属内的异型.
• 提供CRISPR-Cas9 gRNA用于准子过敏原.

主要方法:

• 对C. avellana,C. americana,C. heterophylla和C. mandshurica的基因组组合进行比较基因组学分析.
• 鉴定和科尔的基因分析一个过敏原同类物和isoallergens.
• 针对Cor a基因沉默的CRISPR-Cas9 gRNAs的生物信息设计.

主要成果:

• 在分析的科里卢斯物种中,确定了52个Cor a的正义词.
• 最近在C. americana中发现了Cor a 1的双重复制;预测了Cor a 16和Cor a 10的新基因模型.
• 确定了56种Coraa异敏原和10种Coraa异型,植物遗传学分析显示了Cora1,Cora2和Cora TLP的进化复杂性.

结论:

• 这项研究加深了对Corylus属内桃过敏原演变的理解.
• 高精度的目标CRISPR-Cas9 gRNAs被开发用于准子过敏组.
• 这些发现支持通过先进的生物技术开发低过敏性子品种.