针对下一代测序试验的实验室验证,用于在下呼吸道感染中检测病原体

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 分子诊断学 分子诊断
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 下呼吸道感染 (LRTI) 由于病原体检测和诊断的困难,对全球健康构成重大挑战.
• 传统的LRTI微生物检测方法耗时,通常需要3-5天,延迟了适当的患者治疗.
• 目标下一代测序 (tNGS) 已成为微生物检测的有希望的技术,在临床环境中具有巨大的潜力.

研究的目的:

• 验证针对性下一代测序 (tNGS) 的分析和临床性能,用于检测引起LRTI的病原体.
• 为在LRTI的常规临床诊断中更广泛地采用和实施tNGS提供科学基础.
• 与现有的诊断方法相比,评估tNGS的准确性,速度和成本效益.

主要方法:

• 开发和使用模拟的微生物样本面板,严格评估tNGS的分析有效性.
• 应用tNGS来分析诊断或怀疑患有LRTI的108名患者的呼吸道样本,以确定临床有效性.
• 评估tNGS性能指标,包括特异性,敏感性,精度,稳定性,正预测值和负预测值.

主要成果:

• tNGS在低温储存下表现出卓越的分析特异性,灵敏度,精度和稳定性.
• 在临床验证中,tNGS平台在LRTI诊断方面获得了84.38%的灵敏度和91.67%的特异性.
• tNGS提供了显著缩短的周转时间 (约. 16小时) 与传统方法 (3-5天) 相比,并且比元基因组测序更具成本效益.

结论:

• 针对性下一代测序 (tNGS) 是诊断下呼吸道感染 (LRTI) 的可靠和有效方法.
• tNGS表现出强大的分析和临床有效性,有效地检测到常见的LRTI病原体,并发感染和非典型病原体.
• 凭借其快速的交付时间,可接受的成本和高准确性,tNGS有望增强LRTI目前的临床病原体检测策略.