沉默TET1表达改变了表观基因组格局,并放大了气道上皮细胞对过敏原的转录基因反应

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 分子生物学分子生物学
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.

背景情况:

• 十-十一转位甲基细胞二氧化酶1 (TET1) 已知在室内灰尘虫 (HDM) 引起的过敏气道炎症中起着保护作用.
• TET1调节了参与人类支气管上皮细胞 (HBEC) 喘病原发生的基因.
• 在这种情况下,TET1控制基因表达的精确分子机制尚不清楚.

研究的目的:

• 阐明TET1在HDM引起的过敏气道炎症中的调节机制.
• 为了研究TET1如何影响基因表达,DNA甲基化,染色质可访问性和HBECs中的基因组修饰在HDM暴露时.

主要方法:

• 多组学分析包括mRNA表达,DNA甲基化和染色体可访问性分析.
• 在HBEC中降低TET1,然后进行HDM提取物治疗.
• 转录因子丰富分析和H3K27ac水平评估.

主要成果:

• 降低TET1和HDM治疗诱导了类似的转录基因变化,富含了喘相关的基因和途径.
• 这两种情况都导致共享基因组位置的染色质可访问性降低,可能涉及CTCF和C / EBP结合.
• TET1损失影响了增强剂活性 (H3K27ac),并导致非可访问区域的DNA甲基化变化.

结论:

• TET1采用不同的机制来调节气道上皮细胞中不同基因组区域的基因表达.
• TET1限制了对过敏原的转录基因反应,这表明它在抗喘发展方面起着保护作用.