为评估各种人类癌症中调节失调的LncRNA中的G4s而编制的数据集
Shubham Sharma1, Muhammad Yusuf Hassan2,3, Noman Hanif Barbhuiya4
1Department of Biological Sciences and Engineering, Indian Institute of Technology Gandhinagar, Gandhinagar, Gujarat, 382055, India.
Scientific data
|May 23, 2025
概括
这项研究介绍了一个数据集,将长非编码RNA (lncRNA) 与癌症联系起来,详细介绍了它们的G-四 (G4) 形成潜力. 本资源有助于研究G4介导的lncRNA功能和癌症中的相互作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 长非编码RNAs (lncRNAs) 在癌症发展中发挥作用.
- 在lncRNA中的G-四重复 (G4s) 越来越多地被认为具有生物学意义.
- 缺乏对癌症相关 lncRNAs 中 G4s 的系统评估.
研究的目的:
- 创建一个关于lncRNAs,它们的癌症关联以及预测G4形成潜力的综合数据集.
- 为了促进对人类癌症中G4介导的lncRNA功能的研究.
- 为了探索G4介导的lncRNA-蛋白相互作用.
主要方法:
- 实验验证的lncRNA与癌症相关性的整合.
- 在 lncRNA 中计算预测 G4 基因.
- G4类型 (2G,3G,4G) 的分类和亚细胞局部化的评估.
- 包括lncRNA-RNA和lncRNA-蛋白相互作用数据,以及RNA G4结合蛋白信息.
主要成果:
- 一个精心策划的数据集,将lncRNAs,癌症相关性和G4潜力联系起来.
- 预测G4基因和lncRNA局部化的详细分类.
- 关于lncRNA相互作用和G4结合蛋白的能力的信息.
结论:
- 该数据集是研究癌症中G4介导的lncRNA功能的宝贵资源.
- 提供了由G4结构驱动的lncRNA-蛋白相互作用的见解.
- 为癌症诊断和针对 lncRNA G4s 的治疗开辟了新的途径.
