在中对内网膜与压力相关的DEG进行查,分析和验证
Sunyena Shi1, Xu Feng1, Zhan Cao1
1Department of Neurology, The Second Affiliated Hospital of Harbin Medical University, Harbin, 150086, China.
Cellular and molecular neurobiology
|May 25, 2025
概括
细胞内膜网膜压力 (ERS) 与有关. 生物信息学分析确定了8个关键基因,包括CXCL8,作为的潜在诊断标志物,表明ERS参与炎症和神经元亡.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 是一种复杂的神经系统疾病,其潜在的分子机制仍在研究中.
- 细胞内膜网膜压力 (ERS) 与各种细胞功能障碍有关,但其在中的特定作用需要进一步阐明.
研究的目的:
- 使用生物信息学方法研究内细胞网膜压力 (ERS) 和之间的关联.
- 确定潜在的诊断生物标志物,并探索ERS在中的生物功能.
主要方法:
- 从GEO数据库下载并分析了GSE143272数据集.
- 确定了差异表达基因 (DEGs),并与ERS相关基因进行了交叉分析.
- 构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络,选了枢纽基因,并进行了ROC曲线分析和qRT-PCR验证.
主要成果:
- 在中发现了83种与ERS相关的DEG.
- 通过PPI网络分析确定了八个特征基因 (CXCL8,TLR4,MMP9,TNFRSF1A,PTGS2,STAT1,BCL2,RELA).
- 这八个基因组合显示出高诊断潜力,CXCL8是最重要的生物标志物. 在患者中,CXCL8mRNA表达显著下降.
结论:
- 埃尔斯在中发挥作用,可能通过炎症和神经元亡途径.
- 这些已识别的基因,特别是CXCL8,有可能成为的诊断生物标志物.
- 这项研究提供了生物信息学证据,以了解中的ERS病理学,并建议治疗点.
