相关实验视频

Updated: Jan 18, 2026

Silencing the Spark: CRISPR/Cas9 Genome Editing in Weakly Electric Fish

Silencing the Spark: CRISPR/Cas9 Genome Editing in Weakly Electric Fish

Published on: October 27, 2019

白 (Morone americana) 的两个基因组,这是一个生态上重要的远距离生物

Josephine R Paris¹, Megan A Criss², Jessica L Walsh²

¹Industrial Economics, Incorporated (IEc), Cambridge, MA, United States.

The Journal of heredity

|May 30, 2025

概括

我们生成了白 (Morone americana) 的高质量基因组组合,这是一个关键的生物指标物种. 这些基因组资源将有助于研究其侵入性和监测杂交.

科学领域:

基因组学就是基因组学.
生态生态学生态生态学
生物指标生物指标

背景情况:

白 (Morone americana) 在北美东海岸具有生态意义.
由于其丰富和广泛分布,它作为污染物暴露的生物指标.
这种物种在本土范围之外具有侵入性,影响当地生态系统,并与相关物种杂交.

研究的目的:

为了生成白的高度连续的基因组组合.
提供基因组资源,以促进白作为生物指标的发展.
支持对该物种的入侵性和物种内杂交的研究.

主要方法:

在基因组组装中使用了PacBio HiFi测序技术.
高的BUSCO和k-mer完整度得分在女性和男性组合中都得到了实现.
转录组数据和蛋白质数据库被用于高质量的基因注释.

主要成果:

产生了两个高度连续的基因组组件 (女性:694 Mb,男性:688 Mb).
这两种组合都表现出极好的完整性 (女性:98.7%BUSCO,男性:98.8%BUSCO).
对女性基因组的高质量注释确定了20699个蛋白质编码基因.

结论:

生成的参考基因组对于开发白作为生物指标至关重要.
这些基因组工具将有助于研究白的入侵性.
这些组件将能够对白种群的物种内杂交进行基因组监测.

关键词:

它们属于Moronidae.水生动物水生动物水生动物生物指标生物指标混合化混合化混合化这是一种侵入性侵袭性疾病.参考基因组是指基因组中的基因组.

更多相关视频

Necropsy-based Wild Fish Health Assessment

Necropsy-based Wild Fish Health Assessment

Published on: September 11, 2018

Genome Editing in Astyanax mexicanus Using Transcription Activator-like Effector Nucleases TALENs

Genome Editing in Astyanax mexicanus Using Transcription Activator-like Effector Nucleases TALENs

Published on: June 20, 2016

相关概念视频

Osmoregulation in Fishes

Osmoregulation in Fishes

When cells are placed in a hypotonic (low-salt) fluid, they can swell and burst. Meanwhile, cells in a hypertonic solution—with a higher salt concentration—can shrivel and die. How do fish cells avoid these gruesome fates in hypotonic freshwater or hypertonic seawater environments?

Position-effect Variegation

Position-effect Variegation

In 1928, a German botanist Emil Heitz observed the moss nuclei with a DNA binding dye. He observed that while some chromatin regions decondense and spread out in the interphase nucleus, others do not. He termed them euchromatin and heterochromatin, respectively. He proposed that the heterochromatin regions reflect a functionally inactive state of the genome. It was later confirmed that heterochromatin is transcriptionally repressed, and euchromatin is transcriptionally active chromatin.