一个用于新型寡核酸序列的验证工作流程,以扩大CO-Detection by Indexing (CODEX) 平台的复合能力
Alexander Rochwarger1, Louisa Kaufmann2, Jing Zhao1
1Department of Pathology and Neuropathology, University Hospital and Comprehensive Cancer Center Tübingen, Tübingen, Germany.
概括
研究人员开发了新的DNA条形码,以扩大CO-Detection通过索引 (CODEX) 成像的多重复合能力. 这一进步允许85个以上的标记物,增强空间生物学和组织微环境分析.
科学领域:
- 空间生物学 空间生物学
- 分子成像学分子成像学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 多复合组织成像对于生物发现和临床转化至关重要.
- CO-Detection by Indexing (CODEX) 平台使用DNA结合抗体,但受到可用的DNA条形码的限制.
- 扩大复杂化能力对于先进的空间分析至关重要.
研究的目的:
- 为CODEX平台开发和验证新的DNA-寡核酸序列.
- 增加CODEX的多重复合能力,以进行增强的组织分析.
- 为扩展CODEX功能提供可复制的工作流.
主要方法:
- 使用现有和候选DNA条形码进行了交叉验证多循环实验.
- 建立了一个用于验证和引入新的DNA寡核酸序列的工作流.
- 新的条形码的实用性得到了证实,使用在嵌组织微阵列上的74个复合体抗体面板.
主要成果:
- 一组27个CODEX的新型寡核酸序列被成功验证.
- 新的序列将CODEX的潜在多重复合能力提高到超过85个标记.
- 这个由74人组成的小组展示了扩展的CODEX平台的实际应用.
结论:
- 该研究提出了一种可复制的方法,用于扩展CODEX的复杂化能力.
- 经过验证的新型DNA条形码显著提高了平台对高复合成像的潜力.
- 这一进步有助于更深入地了解复杂的组织微环境.
