介素-8的形态可塑性介导其与强大的抑制剂苏拉明的动态分子相互作用
Nupur Nagar1, Krishnakant Gangele1, Purba Daripa1
1Department of Biosciences and Bioengineering, Indian Institute of Technology Roorkee, Roorkee, Uttarakhand 247667, India.
Journal of chemical information and modeling
|May 30, 2025
概括
这项研究表明,硫胺衍生物苏拉明与关键的炎症蛋白质 - - 介质素-8 (IL8) 相互作用. 苏拉明·苏拉明 (Suramin Suramin) 是一个著名的
科学领域:
- 蛋白质结构可塑性及其在分子相互作用中的作用.
- 药物发现和抗炎疗法的开发.
背景情况:
- 蛋白质结构可塑性对于调解蛋白质-蛋白质/连接体相互作用,影响特异性和作为药物发现中的速度限制步骤至关重要.
- 化学因子,就像介素-8 (IL8/CXCL8) 一样,是因其可塑性和与化学因子受体 (GPCRs) 和糖氨基酸甘氨酸 (GAGs) 的相互作用而闻名的炎症蛋白.
- IL8/CXCL8与各种疾病有关,使其成为抗炎药物开发的关键目标.
研究的目的:
- 研究硫胺衍生物苏拉的潜力,作为IL8的交互因子.
- 阐明蛋白质可塑性在IL8-苏拉明相互作用中的作用.
- 探索苏拉明作为IL8介导炎症状况的抑制剂的潜力.
主要方法:
- 利用计算和生物物理技术的组合来研究IL8-suramin相互作用.
- 分析了结合能量,以确定解离常数 (Kd).
- 确定结构数据以确定结合部位并评估相互作用的稳定性,动态性和合规性.
主要成果:
- 苏拉明与IL8相互作用,其解离常数为3.02 ± 0.4μM.
- 结构分析显示,suramin在受体/GAG结合口袋内与IL8结合,与已知的结合部位重叠.
- 蛋白质的可塑性和异质性被确定为影响IL8-苏拉胺相互作用的稳定性,动态性和一致性的关键因素.
结论:
- 这项研究强调了蛋白质可塑性在蛋白质-配体/抑制剂相互作用中的重要作用.
- 这些发现表明,苏拉明作为一种潜在的抑制剂,可以向化基因-GAG/受体相互作用.
- 苏拉明与IL8的相互作用表明它在调节IL8介导的炎症状况方面具有实用性.
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