通过高通量测序揭示了制药生产水中的细菌群体结构和占主导地位的物种
Saori Shikama1, Kimiko Uchii2, Makoto Sadamitsu3
1Pharmaceutical Sciences, Takeda Pharmaceutical Co., Ltd., Fujisawa, Kanagawa 251-8555, Japan; Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Osaka Ohtani University, Tondabayashi, Osaka 584-8540, Japan.
概括
高通量测序可以快速识别制药水中的细菌. 这种先进的方法比传统培养技术提供了更快的生物负担监测,提高了药物安全性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 制药科学 制药科学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 药品水的微生物控制对于药物安全至关重要.
- 鉴定微生物污染物的传统培养方法耗时,延迟了质量控制.
研究的目的:
- 展示高通量测序 (HTS) 的应用,用于制药用水系统中的快速细菌分析.
- 将HTS的效率与生物负担监测的传统培养方法进行比较.
主要方法:
- 使用了牛津纳米孔技术 (Oxford Nanopore Technologies) 的MINION平台,用于制药用水样本的HTS.
- 在停滞样本采集港口分析了细菌群落结构和主导物种.
- 在不同水处理阶段跟踪细菌组成的动态变化.
主要成果:
- 在制药水中成功识别了细菌群落和主导物种.
- 在细菌群体中检测到的动态变化:弗雷阿托巴克特 (城市水),甲基巴克特 (反透) 和拉尔斯托尼亚 (超透).
- HTS提供了细菌组成的快速表征,比培养方法快得多.
结论:
- 特别是在使用MinION平台的HTS提供了一种快速且具有成本效益的分子方法,用于在制药水中识别细菌.
- 该方法与实施快速微生物学方法的监管建议保持一致.
- 该研究强调了HTS在制药制造中的全面生物负担监测中的实际实用性.
