在Martellivirales序列内的多细分的杆状真菌病毒的表征,主要适应植物病毒
Mika Yoshioka1, Akihito Fukudome2, Yuto Chiba3
1Laboratory of Fungal Interaction and Molecular Biology (donated by IFO), Department of Life and Environmental Sciences, University of Tsukuba, 1-1-1 Tennodai, Tsukuba, Ibaraki 305-8577, Japan.
这项研究描述了Aspergillus flavus vivivirus 1 (AfViV1),一种新型的真菌RNA病毒. AfViV1具有独特的棒状颗粒,扩大了对真菌病毒多样性的知识,并揭示了与植物病毒的联系.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 在Riboviria领域的Martellivirales序列包括具有单链正感RNA基因组感染多种宿主的病毒.
- 在Martellivirales中提出的"Viviviridae"家族已经通过metatranscriptome数据确定,但其病毒学特征仍然基本未知.
研究的目的:
- 描述Aspergillus flavus vivivirus 1 (AfViV1) 的特征,这种病毒被认为属于"Viviviridae"家族.
- 为了阐明病毒结构,并确定AfViV1.1.的外套蛋白 (CP).
- 探索对真菌和植物病毒多样性和演化的更广泛影响.
主要方法:
- 对AfViV1病毒的形态分析.
- 从AfViV1 RNA12.12中识别和测序毛皮蛋白 (CP) 基因.
- 对序列读取档案 (SRA) 数据的生物信息分析,以确定相关的病毒序列.
- 结构预测和比较AfViV1 CP与已知的病毒蛋白质.
主要成果:
- AfViV1病毒呈现出一种典型的棒状结构.
- 鉴定了AfViV1的外套蛋白 (CP),在其他"Viviviridae"家族病毒中发现了相关的CP序列,这表明了类似的形态.
- AfViV1 CP与Potyviridae和Closteroviridae家族的杆状病毒具有结构上的相似性,但其序列并不显著.
结论:
- 这项研究描述了第一个带有杆状颗粒的多细分真菌ssRNA病毒,显著扩大了已知的真菌RNA病毒的形态多样性.
- 这些发现突显了真菌和植物病毒之间潜在的深层进化关系,特别是在宿主范围和适应方面.
- 这项研究为进一步调查"Viviviridae"家族及其在真菌生态系统中的作用提供了基础.
更多相关视频
09:20Microwave Assisted Rapid Diagnosis of Plant Virus Diseases by Transmission Electron Microscopy
Published on: October 14, 2011
05:56Direct Agroinoculation of Maize Seedlings by Injection with Recombinant Foxtail Mosaic Virus and Sugarcane Mosaic Virus Infectious Clones
Published on: February 27, 2021
相关概念视频
Subviral Agents
Viral Structure
Viruses with RNA Genomes
Fungal Phylum Microsporidia
Bacterial Phylum Tenericutes
Size and Structure of Viral Genomes
