适应和验证胃肠道面板以检测腹病毒病原体在高通量qPCR系统上的高通量qPCR系统

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 分子诊断学 分子诊断
• 病毒学 病毒学

背景情况:

• 传染性胃肠炎每年影响20亿人,肠道病毒导致严重疾病,特别是在儿童和免疫功能低下的人群中.
• 准确和快速检测肠道病毒对于及时诊断,治疗和疫情管理至关重要.

研究的目的:

• 适应和验证一个全自动,高通量胃肠定量聚合酶链反应 (qPCR) 面板,用于同时检测常见的肠道病毒.
• 评估开发的qPCR分析的性能特征,包括检测极限,线性,精度,特异性和灵敏性.

主要方法:

• 在Roches cobas全自动化系统上验证胃肠道qPCR面板,用于检测诺罗病毒 (GI,GII),罗塔病毒,腺病毒,萨波病毒,天体病毒和肠病毒.
• 使用数字滴滴PCR定量化临床便样本确定分析性能指标,并与商业CE-IVD qPCR试验进行比较.

主要成果:

• 该试验在243名患者样本中显示出高特异性 (98.2-100.0%) 和敏感性 (85.7-100.0%).
• 大多数目标的检测极限很低,在5-6个日志步骤中具有很好的线性 (r2: 0.992-0.998).
• 在专属性小组中没有观察到任何虚假阳性,并且外部质量评估样本被正确识别.

结论:

• 一种实验室开发的综合性qPCR试验成功验证了可靠地检测便中的七种常见肠道病毒.
• 该测试为常规诊断和疫情监测中的胃肠道病毒检测提供了快速,自动化和可扩展的高吞吐量解决方案.