细胞建模和拯救一种新的非编码基因原因的糖原储存疾病IX的细胞建模和救援

科学领域:

• 遗传学 是一个遗传学.
• 分子生物学分子生物学
• 罕见疾病 罕见疾病

背景情况:

• 孟德尔病的延迟诊断阻碍了及时的治疗.
• 解释影响拼接和基因表达的非编码变体是一个诊断挑战.
• 两名兄弟姐妹出现了糖原储存疾病 (GSD) 类型IX γ2,有一个已知的致病性PHKG2变种,但没有第二个确定的变种.

研究的目的:

• 在患有GSD型IX的兄弟姐妹中识别PHKG2中缺失的致病变体 γ2.2.
• 为了在功能上验证一种新型的深层内联拼接变体.
• 为了证明一种治疗策略来逆转异常拼接.

主要方法:

• 全基因组测序 (WGS) 用于检测变异.
• 使用患者血液和CRISPR编辑的HEK293T细胞模型进行RNA测序 (RNA-seq).
• 编辑CRISPR基因以安装该变种.
• 用于治疗验证的反意义拼接切换寡核酸 (ASO).

主要成果:

• 在两个兄弟姐妹中,在PHKG2中发现了一种深度内联拼接变体.
• 功能性研究证实了该变体对拼接和细胞功能的影响,与GSD IX γ2.2一致.
• 在细胞模型中使用ASO成功逆转了异常拼接.

结论:

• 深度内在变异可能是罕见遗传疾病的重要原因,如GSD IX γ2.
• 与功能性RNA-seq和细胞模型相结合的WGS提供了一种强大的方法来识别和验证非编码的致病变体.
• 在罕见的遗传疾病中,ASO为逆转拼接缺陷提供了一个有希望的治疗途径.