一种简化的提取方法减少了非结核性菌根菌的蛋白质识别的处理时间
Ramiro López-Medrano1, Isabel Burgos-Asurmendi2, Octavio Rivero-Lezcano3
1Servicio de Microbiología Clínica, Complejo Asistencial Universitario de León, Gerencia Regional de Salud de Castilla y León (SACYL), León, Spain.
概括
一种新的,简化的蛋白质组提取方法提高了使用MALDI-TOF MS.的非结核性真菌菌 (NTM) 鉴定. 这种更快的协议保持了准确的识别分数,并确保了临床和环境NTM菌株的生物安全性.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 非结核性真菌菌 (NTM) 的鉴定已经通过蛋白质组方法取得了进展.
- 在NTM蛋白质组模式的地理变化挑战了通用数据库的准确性.
研究的目的:
- 为NTM识别开发和验证一个优化的,简化的蛋白质分子提取协议.
- 将新协议与制造商推的 MALDI-TOF MS. 的方法进行比较.
主要方法:
- 使用单个酸步骤的替代提取协议被开发,优化,并与现有方法进行比较.
- 分析了120个临床NTM分离物,1个环境菌株和质量控制.
- 通过在提取程序后测试NTM可行性来评估生物安全性.
主要成果:
- 优化的协议为缓慢生长的NTM提供了1.61-2.16的识别分数范围,为快速生长的NTM提供了1.66-2.33的分数范围.
- 在酸提取步骤后没有观察到NTM活力,证实了生物安全性.
结论:
- 使用MALDI-TOF MS成功开发了一种更简单,更快速的NTM蛋白质识别程序.
- 新方法在不影响生物安全的情况下实现了显著的识别分数.
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