对食源性病原体监测的元基因组方法进行批判性审查
Jia Wang1, Henk C den Bakker2, Thomas G Denes1
1Department of Food Science, The University of Tennessee, Knoxville, Knoxville, TN, USA.
Critical reviews in food science and nutrition
|June 6, 2025
概括
转基因组学为食源性病原体监测提供了一种强大而公正的方法,改善了检测和表征. 这项技术有望通过分析来自各种来源的遗传物质,增强公共卫生反应并减少食源性疾病.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 食品安全 食品安全
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 目前的食品传播病原体监测方法资源密集,规模有限.
- 高通量测序,包括元基因组学,正在彻底改变微生物学和公共卫生.
- 需要创新技术来快速准确地识别各种食物传播病原体.
研究的目的:
- 探索元基因组学在食品传播病原体监测和疫情检测中的应用.
- 为此目的,审查近期短读和长读测序技术的进展.
- 讨论食品安全中的元基因组学的挑战和未来前景.
主要方法:
- 对基于元基因组学的方法进行病原体识别的审查.
- 专注于短读和长读测序技术.
- 从临床,食品和环境样本中分析遗传物质.
主要成果:
- 甲基因组学能够对食物传播病原体进行公正,全面的分析.
- 短读和长读测序为病原体检测提供了进步.
- 挑战包括低丰富性病原体检测,复杂组装和抗菌素耐药性基因识别.
结论:
- 转基因组学是改变食品传播病原体监测的一个有前途的战略.
- 在测序和分析方面不断的改进将使元基因组方法成为常规.
- 超基因组应用有可能显著降低食物传播疾病的负担.
