验证变异效应的多重测定数据:对NHS临床科学家进行的CanVIG-UK全国调查
Sophie Allen1, Alice Garrett2, Charlie F Rowlands1
1Division of Genetics and Epidemiology, the Institute of Cancer Research, London, UK.
American journal of human genetics
|June 6, 2025
概括
变异效应多重检测 (MAVEs) 的临床采用需要可信的中央机构来验证功能遗传变异数据. 如果没有这种验证,在诊断报告中广泛使用将被显著推迟.
科学领域:
- 基因组医学是一种基因组医学.
- 临床遗传学 临床遗传学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 变异效应多重测试 (MAVEs) 可以产生大规模的功能遗传数据.
- 由于需要强大的验证和可获得的资源,MAVE的临床采用受到阻碍.
研究的目的:
- 评估英国临床科学家和遗传学家对MAVE数据临床验证的要求和信心水平.
- 确定将MAVE数据纳入常规变异分类中的障碍和促进因素.
主要方法:
- 在英国癌症变异解释小组 (CanVIG-UK) 会议上,对46名临床科学家和遗传学家进行了调查.
- 参与者被问及他们接受MAVE验证,首选的验证机构以及数据可访问性需求.
主要成果:
- 只有35%的人会接受作者提供的验证; 61%的人更喜欢由受信任的中央机构进行验证.
- 72%的受访者会在公布之前使用MAVE数据,如果被信任的中央机构验证.
- 在验证过程中,CanVIG-UK,VCEPs和ClinGen SVI功能工作组获得了较高的信任分数.
结论:
- 值得信赖的中央机构对于验证MAVE数据至关重要,以使其在临床上得到采用.
- 可访问,验证的MAVE数据对于诊断环境中的常规变异分类至关重要.
- 中央验证的延迟将阻碍MAVE的临床实用性.


